База данных генов человека, вовлеченных в ответ на инфекцию вирусного клещевого энцефалита (ЭнцеГенХост/TBEVHostDB)

Разработчик: ФГБНУ «ФИЦ ИЦиГ СО РАН»

Авторы: Игнатьева Е. В., Игошин А. В., Юдин Н.С.

Краткая характеристика:

База данных «ЭнцеГенХост» содержит каталог генов-кандидатов, потенциально вовлеченных в ответ на инфекцию вирусного клещевого энцефалита у человека. Все гены, включенные в каталог, были собраны вручную на основе анализа научных источников, представленных в базе публикаций «PubMed». Для каждого гена имеются гиперссылки для перехода к базам данных системы «NCBI» («EntrezGene», «PubMed»), а также, где необходимо, к базе «dbSNP». База данных содержит сведения о научном источнике, об экспериментальных методах выявления генов-кандидатов, виде организма-хозяина, инфицированного вирусом, и иную сопутствующую информацию.

Области возможного использования:

База данных может быть использована в области геномики инфекционных заболеваний.

Степень готовности разработки к практическому применению:

База данных готова к практическому применению и доступна в сети Интернет по адресу http://icg.nsc.ru/TBEVHostDB/ .

Возможный технический и (или) экономический эффект

База данных может быть использована для оценки генетических факторов риска, предрасполагающих к тяжелым формам вирусного клещевого энцефалита, и поиска терапевтических мишеней при разработке методов лечения данного заболевания.

Сравнительные характеристики с известными разработками

База данных «ЭнцеГенХост» представляет собой первый в мире информационный ресурс, позволяющий в систематизированном виде получить информацию о генах, потенциально вовлеченных в ответ на инфекцию вирусом клещевого энцефалита у человека. Единственная известная база данных по сходной тематике (взаимодействие вирусов с клетками хозяина) VirHostNet (http://virhostnet.prabi.fr/) содержит данные о белок-белковых взаимодействиях между белком NS5 вируса клещевого энцефалита и 33 белками человека, полученные методом дигибридного анализа в дрожжевых клетках, но данные не полны, поскольку в качестве экспериментальной мишени был исследован только один вирусный белок.

Защита разработки: Свидетельство о госрегистрации № 2019620937, зарег. 03.06.2019.