Программа для ЭВМ «Визуализация хромосомоспецифичных последовательностей ДНК при проведении FISH (ВижуалКС)»

Патентообладатель

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр институт цитологии и генетики» (ИЦиГ СО РАН).

Авторы
Богомолов А.Г., Подколодный Н.Л., Рубцов Н.Б.

Краткая характеристика

Программа «ВижуалКС» предназначена для визуализации хромосомоспецифичных последовательностей ДНК при проведении многоцветной флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) без супрессии и неполной супрессии повторенных последовательностей.

Области возможного использования

Программа «ВижуалКС» может быть использована в области генетики, молекулярной биологии, медицины и биотехнологии.

Степень готовности разработки к практическому применению

Программа «ВижуалКС» готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Программа позволяет сократить объем используемой Cot-1 ДНК в ходе проведения FISH-диагностики и тем самым снизить ее стоимость. Но более перспективным является использование компьютерной обработки в ходе молекулярно-цитогенетических исследований хромосом тех организмов, для которых супрессионная гибридизация in situ (CISS-гибридизация) не дает удовлетворительных результатов, или в принципе не может быть выполнена. Таким образом программа открывает новые возможности в исследовании организации геномов малоизученных видов.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Реализованный в программе метод VISSIS (Богомолов и др., 2012) разрабатывался как альтернатива традиционному подходу – супрессионной гибридизации in situ (CISS-гибридизация). В отличии от предложенного компьютерного подхода, CISS-гибридизация не может быть проведена для хромосом ряда видов эукариот из-за трудностей получения Cot ДНК или большой доли повторенных последовательностей в геноме.

Ближайшим программным аналогом является процедура улучшения результатов гибридизации in situ (Rens et al., 2006). В отличие от указанной процедуры, реализованный вариант цифровой обработки в программе VisualCS не зависит от субъективного мнения пользователя, снижает или полностью удаляет неспецифический сигнал на всех хромосомах.

Патентная защита разработки

Свидетельство о госрегистрации № 2018662647, зарег. 12.10.2018.