База данных «Дифференциальный альтернативный сплайсинг генов человека при вторичной глиобластоме (ДАСГГ)»

Разработчик: ФГБНУ «ФИЦ ИЦиГ СО РАН»

Авторы: Брагин А.О., Губанова Н.В., Бабенко В.Н., Богомолов А.Г., Цуканов А.В., Леберфарб Е.Ю., Орлов Ю.Л.

Краткая характеристика:

База данных «ДАСГГ» является компьютерной технологией в области системной биологии и биомедицины. База данных представляет варианты дифференциального альтернативного сплайсинга и уровней экспрессии изоформ генов человека, полученных на культурах клеток глиом с помощью экспериментов транскриптомного профилирования. Представлены варианты изоформ генов с различной экспрессией на выборках в глиобластоме и здоровой ткани. База данных имеет графический web-интерфейс, который предоставляет пользователям возможность проводить поиск интересующих образцов, планировать эксперименты и обеспечивает хранение данных о различных экспериментах и образцах генов, оптимизируя научно-исследовательский процесс в области молекулярно-биологических и биомедицинских исследований. База данных содержит информацию о транскрипте, об уровнях экспрессии данного транскрипта и значимости различий в выборках, а также ссылки на международные базы данных. Структура базы позволяет пополнять ее данными других транскриптомных экспериментов по изучению экспрессии генов в опухолях.

Области возможного использования:

База данных разработана для медиков и исследователей, которые заинтересованы в получении информации об альтернативном сплайсинге при опухолях на первичных культурах клеток.

Степень готовности разработки к практическому применению:

База данных «ДАСГГ» готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Возможный технический эффект ‑ применение базы данных для медицинских исследований, для эффективного поиска генов-кандидатов и отдельных изоформ генов, определяющих пролиферацию глиобластомы, что служит основой определения генов для терапевтического лекарственного воздействия.

Сравнительные характеристики с известными разработками

База данных содержит уникальный материал по дифференциальной экспрессии и дифференциальному альтернативному сплайсингу на культурах клеток вторичной глиобластомы человека, не представленный в существующих международных базах данных (GEO NCBI).

Защита разработки: Свидетельство о госрегистрации № 2018621416, зарег. 31.08.2018.