Базы данных:  «Дифференциально экспрессирующиеся гены в мозге депрессивных мышей линии С57BL/6J, ассоциируемые с агонистическими взаимодействиями»

Патентообладатель

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Кудрявцева Н.Н., Смагин Д.А., Коваленко И.Л., Галямина А.Г.

Краткая характеристика

Разработанные базы данных предназначены для хранения информации о дифференциально экспрессирующихся генах в пяти отделах головного мозга — в гипоталамусе, гиппокампе, вентральной тегментальной области, ядрах шва среднего мозга и стриатуме — мышей линии C57BL/6J с агрессивным и депрессивным типами поведения, выявленных при использовании полнотранкриптомного анализа.  В базах данных представлена информация о дифференциальной экспрессии более 30000 генов, их идентификация, расположение в хромосоме, значения FPKM для животных со смешанным тревожно/депрессивным расстройством и с патологией агрессивного поведения по типу психоза, статистическая обработка данных.

Области возможного использования

Базы данных могут быть использованы для изучения структурно-функциональной перестройки организации генов, молекулярных изменений, возникающих в процессе развития смешанного тревожно/депрессивного или патологии агрессивного поведения по типу психоза, изучения механизмов нейрогенеза, поиска генов кандидатов для фармакологического воздействия и т.д. Изменение экспрессии генов может служить маркером участия структур мозга и определенных генов в механизмах ответа на приобретение последовательного опыта агонистических взаимодействий, с одной стороны. С другой, база данных позволит изучать особенности вовлечения генов, под которыми можно понимать направленность и выраженность изменений, а также количество генов, курирующих разные биохимические процессы.

Степень готовности разработки к практическому применению

Базы данных готовы к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Базы данных могут быть полезны для специалистов в области молекулярной психиатрии для поиска ключевых звеньев регуляции формирования патологических процессов, таких как смешанное тревожно/депрессивное расстройство, генерализованная тревожность, повышенная агрессивность, сопровождаемых развитием неврологических симптомов, психогенного иммунодефицита и др., с целью разработки нового подхода к терапии генов, кодирующих белки, вовлекаемые в развитие болезней. Кроме того, базы данных дают возможность исследовать молекулярные механизмы взаимодействия генов при различных функциональных нагрузках.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Базы данных дифференциально экспрессирующихся генов в отделах мозга мышей с развитием психоэмоциональных и неврологических расстройств являются уникальным, высокоэффективным, надежным и информативным ресурсом для исследования механизмов функционирования мозга и не имеют аналогов.

Патентная защита разработки

Свидетельства о регистрации, зарегистрированные в Реестре БД  № 2016620892 от 29.06.2016, 2016620876 от 27.06.2016, 2016620859 от 23.06.2016, 2016620939 от 12.07.2016, 2016620981 от 20.07.2016.