База данных «Гены устойчивости к грибным патогенам (ГУГП)»

Патентообладатель

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Смирнова О.Г., Кочетов А.В., Рассказов Д.А.

Краткая характеристика

В базе «ГУГП» представлены нуклеотидные последовательности генов устойчивости, а также данные об отдельных однонуклеотидных полиморфизмах генов, ассоциированных с различными уровнями устойчивости к заболеваниям.

Области возможного использования

База данных «ГУГП» предназначена для сбора и хранения данных о генах, обеспечивающих устойчивость пшеницы и родственных ей злаков к заболеваниям, вызванных грибными патогенами.

Степень готовности разработки к практическому применению

База данных «ГУГП» готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

База данных «ГУГП» полезна для исследователей, работающих в области генетики и селекции растений, которые занимаются изучением генетического контроля устойчивости к патогенам и созданием форм пшеницы с улучшенными свойствами. Представление данных в системном виде, наличие словарей и системы поиска позволяет ускорить получение разнообразной информации о генах устойчивости у злаков, посмотреть место этого гена в защитном ответе и получить нуклеотидную последовательность выбранного гена. База «ГУГП» позволяет существенно сократить время по сравнению с поиском подобной информации в Интернете, что имеет экономический эффект. В связи с этим необходимо постоянное обновление содержащейся в базе «ГУГП» информации и развитие базы за счет аннотирования новых генов.

Сравнительные характеристики с известными разработками

В области изучения генов устойчивости растений известна база «Plant Resistance Genes» (http://prgdb.org), в которой приведены нуклеотидные последовательности 112 известных и более чем 100000 предполагаемых генов устойчивости, присутствующих у 233 видов растений (Sanseverino et al., 2013). Недостатками известной базы являются отсутствие информации об уровне экспрессии генов, мутантных вариантах генов и их влиянии на устойчивость, а также об участии этих генов в метаболических процессах. Также в базу не включена информация о генах, не являющихся по своей структуре генами устойчивости, но принимающими участие в формировании защитного ответа.

Патентная защита разработки

Свидетельство о регистрации № 2016620429, зарегистрирована в Реестре программ для ЭВМ 07.04.2016

.