Archive for Март, 2009

Journal club 1 апреля в 12-00 в конференц-зале

Вторник, Март 31st, 2009

Сорокин М.А.
Динамика активности отцовской Х-хромосомы в ходе процесса импринтированной инактивации

Доклад по статье
Patrat C., Okamoto I., Diabangouaya P., Vialon V., Le Baccon P., Chow J., Heard E. Dynamic changes in paternal X-chromosome activity during imprinted X-chromosome inactivation in mice // PNAS. 2009.
аннотация
У млекопитающих компенсация различий в дозе генов Х-хромосомы между самцами и самками достигается путем инактивации одной из двух Х-хромосом у самок. В раннем развитии мыши сначала имеет место так называемая импринтированная инактивация, в ходе которой во всех клетках предымплантационного зародыша инактивируется только отцовская Х-хромосома (X paternal, Xp). Одна из гипотез предполагает, что в ранних зародышах самок Хр уже находится в преинактивированной форме благодаря предшествующей инактивации этой хромосомы в ходе мейоза в половой линии самца.
Какова степень активности Хр в период непосредственно после оплодотворения? Когда начинается сайленсинг Х-сцепленных генов? До недавнего времени это было неизвестно. Авторы статьи систематически исследовали экспрессию нескольких Х сцепленных генов на уровне отдельных клеток предымплантационных зародышей мыши. В результате они наблюдали динамику активности Хр в раннем развитии. Вместо ожидаемого «преинактивированного» состояния авторы обнаружили полную активность Хр на стадии зиготической активации транскрипции. Первые признаки сайленсинга появлялись, начиная с 4-клеточной стадии. Любопытной обнаруженной особенностью была асинхронность инактивации разных генов Х хромосомы. Некоторые локусы демонстрируют раннее начало инактивации (стадия 4-8 клеток), другие же, наоборот, чрезвычайно позднее (постбластоцистные стадии), а часть локусов никогда не достигают полной инактивации. Таким образом, сайленсинг некоторых районов Х-хромосомы происходит вне обычного «временно́го окна» инактивации. Авторы также показали, что избегание инактивации отдельными генами является в высокой степени линеоспецифичным.
Эти данные указывают, что импринтированная инактивация Х-хромосомы у мыши представляет собой гораздо менее слаженный процесс, чем считалось ранее. Импринтированная инактивация вносит существенный вклад в эпигенетическое разнообразие процессов дозовой компенсации в раннем развитии.

Journal club 26 марта в 14-00 в конференц-зале

Вторник, Март 24th, 2009

Савушкина Д.А. представит доклад «Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки больных спинальной мышечной атрофией».
Доклад подготовлен по материалам статьи:
Ebert A.D., Yu J., Rose F.F., Mattis V.B., Lorson C.L., Thomson J.A., Svendsen C.N.
Induced pluripotent stem cells from a spinal muscular atrophy patient // Nature. 2009. V. 457. P. 277–1127.
аннотация
Спинальная мышечная атрофия вызывается наследуемой мутацией гена SMN1, которая приводит к дегенерации двигательных нейронов и, как следствие, к прогрессирующей мышечной слабости, параличам и ранней смерти. В данном исследовании были воспроизведены молекулярные процессы, характерные для этого заболевания, с использованием индуцированных плюрипотентных стволовых (iPS) клеток. iPS-клетки были получены из фибробластов пациента и его матери, у которой нет клинических признаков заболевания, а затем дифференцированы в мотонейроны. Культура нервных клеток пациента использовалась для испытания лекарственных препаратов, потенциально эффективных при спинальной мышечной атрофии. Эта модель позволяет изучать прогрессию заболевания в лаборатории и разрабатывать адекватную терапию. В дальнейшем новая технология позволит получать для исследования любые клетки, пораженные генетическим дефектом.

Отчетная сессия 17 марта 9.30 утреннее заседание

Воскресенье, Март 15th, 2009

Устные доклады
1. Закиян С.М. Избирательная инактивация Х-хромосомы у обыкновенных полевок. — 10 мин.
2. Шевченко А.И. Мейотическая, импринтированная и случайная инактивация Х-хромосомы. 20 мин.
3. Орищенко К.Е. Определение и анализ регуляторных районов центра инактивации Х-хромосомы у обыкновенных полевок. — 20 мин.
4. Дементьева Е.В. Статусы экспрессии и метилирования генов Х-хромосомы в соматических и экстраэмбриональных тканях обыкновенных полевок. — 20 мин.

Стендовые сообщения
8.30-9.30
1. Медведев С.П., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А.. Особенности молекулярно-генетической организации, регуляции и экспрессии генов Oct4 и Nanog у полевок рода Microtus.
2. Григорьева Е.В., Шевченко А.И. Трофобластные стволовые клетки полевки – модель для изучения импринтированной инактивации Х-хромосомы in vitro.
3. Жукова О.А., Орищенко К.Е., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А. Анализ структуры, регуляции и происхождения гена Tsix полевки Microtus rossiaemeridionalis.
4. Малахова А.А., Шевченко А.И., Елисафенко Е.А. Экспрессия в центре инактивации Х-хромосомы у обыкновенных полевок рода Microtus.
5. Мазурок Н.А., Малахова A.A., Шевченко А.И. Инактивация Х-хромосомы в эмбриональных стволовых клетках человека.
6. Мазурок Н.А., Шевченко А.И. Линии стволовых клеток экстраэмбриональной эктодермы обыкновенных полевок.
7. Сорокин М.А., Елисафенко Е.А., Шевченко А.И. Ген Xist и модификации хроматина неактивной Х-хромосомы у Sorex araneus.
8. Захарова И.С., Шевченко А.И. Особенности модификаций хроматина Х-хромосом, связанные с дозовой коммпенсацей у сумчатых.
9. Сорокин М.А., Медведев С.П., Шевченко А.И. Экспрессия генов раннего развития.
10. Васькова Е.А., Павлова С.В., Дементьева Е.В., Шевченко А.И. Модификации хроматина неактивной Х-хромосомы у обыкновенных полевок.

Journal club 12 марта в 14-00 в конференц-зале

Вторник, Март 10th, 2009

Уважаемые коллеги!
Васькова Е.А. представит обзорный доклад
«Мейотическая инактивация половых хромосом у млекопитающих»
аннотация
У самцов в процессе сперматогенеза в мейозе, на стадии пахитены, половые хромосомы подвергаются транскрипционному сайленсингу и образуют половое или XY-тельце. Этот процесс получил название «мейотическая инактивация половых хромосом» (MSCI: meiotic sex chromosome inactivation). Процесс мейотической инактивации половых хромосом сопровождается модификациями хроматина, которые участвуют в процессе репрессии генов. Транскрипционно неактивное состояние половых хромосом сохраняется и после первого деления мейоза, и продолжается во втором делении мейоза и даже на стадии спермиогенеза. Вероятно, Х-хромосома, наследующаяся от отца (Хр), сохраняет в зиготе преинактивированное состояние, являющееся следствием мейотического сайленсинга, и предрасположена к импринтированной инактивации, которая наблюдается на ранних этапах эмбриогенеза у самок млекопитающих. В докладе будут рассмотрены механизм мейотической инактивации, мейотичекий и постмейотический сайленсинг половых хромосом в свете теории о преинактивированном состоянии Хр в зиготе.

Journal club 5 марта в 14-00 в конференц-зале

Вторник, Март 3rd, 2009

Медведев С.П. представит доклад «Получение индуцированных плюрипотентных стволовых клеток из нейральных стволовых клеток мыши».
Доклад подготовлен по материалам статьи:
Kim J.B., Sebastiano V., Wu G., Arauzo-Bravo M.J., Sasse P., Gentile L., Ko K., Ruau D., Ehrich M., van den Boom D., Meyer J., Hubner K., Bernemann C., Ortmeier C., Zenke M., Fleischmann B.K., Zaehres H., Scholer H.R. Oct4-Induced Pluripotency in Adult Neural Stem Cells // Cell. 2009. V. 136. P. 411-419.
Аннотация
Сверхэкспрессия четырех транскрипционных факторов: OCT4, SOX2, KLF4 и C-MYC способна индуцировать плюрипотентность фибробластов человека и мыши. В работе «Oct4-Induced Pluripotency in Adult Neural Stem Cells» авторы попытались репрограммировать нейральные стволовые клетки (НСК). Нейральные стволовые клетки эндогенно экспрессируют ряд факторов необходимых для поддержания плюрипотентности, таких как SOX2, KLF4 и C-MYC. В работе показано, что сверхэкспрессия одного фактора, OCT4, достаточна для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК) из НСК. Полученные линии ИПСК (1F iPS) проявляли свойства, характерные для эмбриональных стволовых клеток как in vitro, так и in vivo. Клетки линий 1F iPS удалось эффективно дифференцировать в НСК, кардиомиоциты и герминальные клетки in vitro. Кроме того, данные клетки успешно формировали тератомы и участвовали в образовании химерных животных in vivo.